MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 87465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016112	T	6	6	24116	24121	0 %	100 %	0 %	0 %	357403406
502	NC_016112	CGG	2	6	24217	24222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403406
503	NC_016112	A	6	6	24281	24286	100 %	0 %	0 %	0 %	357403407
504	NC_016112	TCA	2	6	24348	24353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403407
505	NC_016112	CGGA	2	8	24371	24378	25 %	0 %	50 %	25 %	357403407
506	NC_016112	GAC	2	6	24390	24395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403407
507	NC_016112	A	6	6	24397	24402	100 %	0 %	0 %	0 %	357403407
508	NC_016112	TCAT	2	8	24419	24426	25 %	50 %	0 %	25 %	357403407
509	NC_016112	GCG	2	6	24446	24451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403407
510	NC_016112	ATT	2	6	24464	24469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403407
511	NC_016112	GGT	2	6	24517	24522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403407
512	NC_016112	GCA	2	6	24690	24695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403407
513	NC_016112	T	6	6	24804	24809	0 %	100 %	0 %	0 %	357403407
514	NC_016112	GTT	2	6	24840	24845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403407
515	NC_016112	GCA	2	6	24861	24866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403407
516	NC_016112	CGG	2	6	24900	24905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403407
517	NC_016112	ATC	2	6	24926	24931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403407
518	NC_016112	GGC	2	6	25071	25076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403407
519	NC_016112	CTT	2	6	25125	25130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403408
520	NC_016112	AGG	2	6	25219	25224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403408
521	NC_016112	CAC	2	6	25333	25338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_016112	CTTAA	2	10	25345	25354	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
523	NC_016112	GAG	2	6	25362	25367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016112	T	6	6	25481	25486	0 %	100 %	0 %	0 %	357403409
525	NC_016112	TTAG	2	8	25562	25569	25 %	50 %	25 %	0 %	357403409
526	NC_016112	ATCG	2	8	25623	25630	25 %	25 %	25 %	25 %	357403409
527	NC_016112	TCC	2	6	25634	25639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403409
528	NC_016112	CGT	2	6	25671	25676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403409
529	NC_016112	GCC	2	6	25772	25777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403409
530	NC_016112	GCC	2	6	25813	25818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403409
531	NC_016112	CGT	2	6	25905	25910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403409
532	NC_016112	TGC	2	6	25924	25929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403409
533	NC_016112	TGC	2	6	25945	25950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_016112	ATG	2	6	25959	25964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016112	A	6	6	25992	25997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016112	GCA	2	6	26016	26021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403410
537	NC_016112	T	7	7	26031	26037	0 %	100 %	0 %	0 %	357403410
538	NC_016112	GCAGGG	2	12	26046	26057	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	357403410
539	NC_016112	CGAT	2	8	26096	26103	25 %	25 %	25 %	25 %	357403410
540	NC_016112	ATA	2	6	26121	26126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403410
541	NC_016112	CCG	2	6	26134	26139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403410
542	NC_016112	T	6	6	26142	26147	0 %	100 %	0 %	0 %	357403410
543	NC_016112	ATG	2	6	26167	26172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403410
544	NC_016112	TTC	2	6	26175	26180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403410
545	NC_016112	A	6	6	26193	26198	100 %	0 %	0 %	0 %	357403410
546	NC_016112	CGT	2	6	26225	26230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403410
547	NC_016112	T	6	6	26241	26246	0 %	100 %	0 %	0 %	357403410
548	NC_016112	T	6	6	26310	26315	0 %	100 %	0 %	0 %	357403410
549	NC_016112	ATAGGC	2	12	26355	26366	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357403410
550	NC_016112	GCA	2	6	26433	26438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403410
551	NC_016112	ATAA	2	8	26482	26489	75 %	25 %	0 %	0 %	357403410
552	NC_016112	ACG	2	6	26514	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403411
553	NC_016112	AAC	2	6	26593	26598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403411
554	NC_016112	CAA	2	6	26810	26815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403411
555	NC_016112	T	7	7	26819	26825	0 %	100 %	0 %	0 %	357403411
556	NC_016112	GTCG	2	8	26903	26910	0 %	25 %	50 %	25 %	357403411
557	NC_016112	GTTT	2	8	26944	26951	0 %	75 %	25 %	0 %	357403411
558	NC_016112	CGTCTT	2	12	26977	26988	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	357403411
559	NC_016112	ATA	2	6	27015	27020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403411
560	NC_016112	TAG	2	6	27058	27063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403411
561	NC_016112	A	6	6	27099	27104	100 %	0 %	0 %	0 %	357403411
562	NC_016112	AAC	2	6	27152	27157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016112	ATC	2	6	27160	27165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_016112	TGT	2	6	27175	27180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016112	A	8	8	27181	27188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016112	A	7	7	27215	27221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016112	CAA	2	6	27223	27228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_016112	TGA	2	6	27229	27234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016112	TGTT	2	8	27329	27336	0 %	75 %	25 %	0 %	357403412
570	NC_016112	GTC	2	6	27361	27366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403412
571	NC_016112	TCG	2	6	27494	27499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403412
572	NC_016112	CG	3	6	27613	27618	0 %	0 %	50 %	50 %	357403412
573	NC_016112	CGG	2	6	27629	27634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403412
574	NC_016112	CATC	2	8	27650	27657	25 %	25 %	0 %	50 %	357403412
575	NC_016112	TAA	2	6	27709	27714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403412
576	NC_016112	A	6	6	27721	27726	100 %	0 %	0 %	0 %	357403413
577	NC_016112	AAC	2	6	27745	27750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403413
578	NC_016112	TGTT	2	8	27783	27790	0 %	75 %	25 %	0 %	357403413
579	NC_016112	TA	3	6	27817	27822	50 %	50 %	0 %	0 %	357403413
580	NC_016112	CA	3	6	27858	27863	50 %	0 %	0 %	50 %	357403413
581	NC_016112	CATA	2	8	28069	28076	50 %	25 %	0 %	25 %	357403413
582	NC_016112	ATA	2	6	28268	28273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403413
583	NC_016112	AT	3	6	28290	28295	50 %	50 %	0 %	0 %	357403413
584	NC_016112	GAAA	2	8	28377	28384	75 %	0 %	25 %	0 %	357403413
585	NC_016112	ATT	2	6	28397	28402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403413
586	NC_016112	AAAG	2	8	28411	28418	75 %	0 %	25 %	0 %	357403413
587	NC_016112	GAA	3	9	28429	28437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403413
588	NC_016112	AAC	2	6	28454	28459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403413
589	NC_016112	ACA	2	6	28461	28466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403413
590	NC_016112	TTAG	2	8	28509	28516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016112	A	6	6	28670	28675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016112	CCCG	2	8	28686	28693	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
593	NC_016112	TC	4	8	28835	28842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_016112	A	6	6	28879	28884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016112	ATT	2	6	29024	29029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016112	T	6	6	29028	29033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016112	GC	3	6	29042	29047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_016112	TTA	2	6	29276	29281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016112	CCG	2	6	29325	29330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403414
600	NC_016112	GC	3	6	29341	29346	0 %	0 %	50 %	50 %	357403414
601	NC_016112	TCG	2	6	29397	29402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403414
602	NC_016112	AGA	2	6	29426	29431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403414
603	NC_016112	GAT	2	6	29440	29445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403414
604	NC_016112	ACC	2	6	29477	29482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403414
605	NC_016112	GCG	2	6	29505	29510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403414
606	NC_016112	GCG	2	6	29654	29659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403414
607	NC_016112	GAGCA	2	10	29681	29690	40 %	0 %	40 %	20 %	357403414
608	NC_016112	AGCG	2	8	29694	29701	25 %	0 %	50 %	25 %	357403414
609	NC_016112	CCG	2	6	29754	29759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403414
610	NC_016112	CGA	2	6	29794	29799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403414
611	NC_016112	TTG	2	6	29849	29854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403414
612	NC_016112	CAA	2	6	29884	29889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403414
613	NC_016112	CAA	2	6	29957	29962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403414
614	NC_016112	CAA	2	6	29989	29994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403414
615	NC_016112	AAG	2	6	30135	30140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403414
616	NC_016112	AGA	2	6	30213	30218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403414
617	NC_016112	TTG	2	6	30287	30292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403414
618	NC_016112	CGGC	2	8	30324	30331	0 %	0 %	50 %	50 %	357403414
619	NC_016112	GCA	2	6	30337	30342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403414
620	NC_016112	CGAA	2	8	30355	30362	50 %	0 %	25 %	25 %	357403414
621	NC_016112	GAA	2	6	30379	30384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403414
622	NC_016112	AAGAAA	2	12	30402	30413	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	357403414
623	NC_016112	GAAAA	2	10	30458	30467	80 %	0 %	20 %	0 %	357403414
624	NC_016112	CAA	2	6	30485	30490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403414
625	NC_016112	GCG	2	6	30518	30523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403414
626	NC_016112	ATC	2	6	30617	30622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403414
627	NC_016112	CGG	2	6	30639	30644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403414
628	NC_016112	TGT	2	6	30648	30653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403414
629	NC_016112	CGA	2	6	30685	30690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403414
630	NC_016112	CAG	2	6	30706	30711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403414
631	NC_016112	AAC	2	6	30761	30766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403414
632	NC_016112	AGA	2	6	30835	30840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403414
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636	NC_016112	TTC	2	6	30981	30986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403414
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639	NC_016112	TTC	2	6	31285	31290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403414
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645	NC_016112	T	6	6	31629	31634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_016112	ATA	2	6	31716	31721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_016112	A	7	7	31721	31727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
648	NC_016112	ATA	2	6	31739	31744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_016112	ATA	2	6	31775	31780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_016112	T	6	6	31789	31794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
651	NC_016112	A	7	7	31822	31828	100 %	0 %	0 %	0 %	357403415
652	NC_016112	TTA	2	6	31879	31884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403415
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678	NC_016112	ATTCCA	2	12	33177	33188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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682	NC_016112	TTCC	2	8	33440	33447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
683	NC_016112	ATT	2	6	33512	33517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
684	NC_016112	CGG	2	6	33622	33627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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756	NC_016112	CCG	2	6	37922	37927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403421
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760	NC_016112	AAT	2	6	38163	38168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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762	NC_016112	GAA	2	6	38339	38344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403422
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